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套式聚合酶链式反应（Nested Polymerase Chain Reaction，Nested PCR）是一种基于聚合酶链式反应（PCR）技术的改进方法，用于增加DNA或RNA检测的灵敏度和特异性，在常规的PCR反应中，通常使用一对特异性引物来扩增目标序列，而在套式PCR中，使用了第二对内部引物（内引物），这些内引物的序列位于第一对外部引物（外引物）所针对序列的内部。
套式PCR的基本步骤如下：
1、第一次PCR反应：使用外部引物对样本进行初步扩增。
2、第二次PCR反应：在第一次PCR的产物基础上，使用内部引物对目标序列进行再次扩增，由于内引物的设计更接近目标序列，因此可以进一步提高检测的灵敏度和特异性。
套式PCR的主要优势在于：
1、灵敏度：通过两次扩增，可以检测到更低浓度的目标序列。
2、特异性：内部引物的使用可以减少非特异性扩增，从而提高检测准确性。
3、复杂性检测：对于高度复杂的样本，套式PCR有助于识别并扩增特定的目标序列。
套式PCR广泛应用于基因表达分析、基因突变检测、病原体检测等领域，由于使用了两次扩增，其反应时间相对较长，并且需要更复杂的实验设计，选择合适的引物和设计反应条件也是确保套式PCR成功的关键。